Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INTS4Q96HW7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
INTS4Q96HW7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
INTS4Q96HW7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
INTS4Q96HW7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INTS4Q96HW7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INTS4Q96HW7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
INTS4Q96HW7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
INTS4Q96HW7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
INTS4Q96HW7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
INTS4Q96HW7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms