Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC41A3Q96GZ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC41A3Q96GZ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC41A3Q96GZ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC41A3Q96GZ6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC41A3Q96GZ6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC41A3Q96GZ6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC41A3Q96GZ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A3Q96GZ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC41A3Q96GZ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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