Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APIPQ96GX9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APIPQ96GX9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APIPQ96GX9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APIPQ96GX9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms