Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFT43Q96FT9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFT43Q96FT9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IFT43Q96FT9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT43Q96FT9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT43Q96FT9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT43Q96FT9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT43Q96FT9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT43Q96FT9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT43Q96FT9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFT43Q96FT9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms