Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATG4CQ96DT6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATG4CQ96DT6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATG4CQ96DT6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATG4CQ96DT6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATG4CQ96DT6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms