Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RCN3Q96D15 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RCN3Q96D15 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCN3Q96D15 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms