Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUBGCP3Q96CW5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBGCP3Q96CW5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBGCP3Q96CW5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBGCP3Q96CW5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms