Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRAMD1AQ96CP6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRAMD1AQ96CP6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRAMD1AQ96CP6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms