Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ULK4Q96C45 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ULK4Q96C45 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ULK4Q96C45 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms