Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
RUNDC1Q96C34 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
RUNDC1Q96C34 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RUNDC1Q96C34 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RUNDC1Q96C34 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms