Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VOPP1Q96AW1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VOPP1Q96AW1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VOPP1Q96AW1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms