Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC38A4Q969I6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC38A4Q969I6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms