Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERCC4Q92889 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
ERCC4Q92889 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ERCC4Q92889 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms