Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKL2Q92772 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKL2Q92772 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKL2Q92772 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms