Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC9A6Q92581 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC9A6Q92581 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC9A6Q92581 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms