Protein–RNA interactions for Protein: Q92565

RAPGEF5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF5Q92565 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RAPGEF5Q92565 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAPGEF5Q92565 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAPGEF5Q92565 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms