Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRTOMTQ8WZ04 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
LRTOMTQ8WZ04 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRTOMTQ8WZ04 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 234.8 ms