Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GATAD2BQ8WXI9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GATAD2BQ8WXI9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GATAD2BQ8WXI9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms