Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RUFY2Q8WXA3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RUFY2Q8WXA3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RUFY2Q8WXA3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RUFY2Q8WXA3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms