Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
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C15orf40Q8WUR7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C15orf40Q8WUR7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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C15orf40Q8WUR7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
C15orf40Q8WUR7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C15orf40Q8WUR7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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C15orf40Q8WUR7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C15orf40Q8WUR7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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C15orf40Q8WUR7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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C15orf40Q8WUR7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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C15orf40Q8WUR7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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C15orf40Q8WUR7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C15orf40Q8WUR7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C15orf40Q8WUR7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
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C15orf40Q8WUR7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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C15orf40Q8WUR7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf40Q8WUR7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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C15orf40Q8WUR7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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