Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STAG3L4Q8TBR4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STAG3L4Q8TBR4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
STAG3L4Q8TBR4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STAG3L4Q8TBR4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms