Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KLHDC4Q8TBB5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KLHDC4Q8TBB5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KLHDC4Q8TBB5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KLHDC4Q8TBB5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms