Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GSDMBQ8TAX9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GSDMBQ8TAX9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms