Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET6

CHST13, Carbohydrate sulfotransferase 13, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST13Q8NET6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHST13Q8NET6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHST13Q8NET6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHST13Q8NET6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST13Q8NET6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms