Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF548Q8NEK5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF548Q8NEK5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF548Q8NEK5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
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