Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APCDD1LQ8NCL9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APCDD1LQ8NCL9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APCDD1LQ8NCL9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms