Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COLGALT1Q8NBJ5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
COLGALT1Q8NBJ5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms