Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF1

GLIS1, Zinc finger protein GLIS1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1Q8NBF1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLIS1Q8NBF1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLIS1Q8NBF1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLIS1Q8NBF1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms