Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMEM229BQ8NBD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM229BQ8NBD8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM229BQ8NBD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms