Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SVOPQ8N4V2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SVOPQ8N4V2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SVOPQ8N4V2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms