Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LGI3Q8N145 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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LGI3Q8N145 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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LGI3Q8N145 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LGI3Q8N145 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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LGI3Q8N145 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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LGI3Q8N145 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LGI3Q8N145 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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