Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYCE1Q8N0S2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYCE1Q8N0S2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYCE1Q8N0S2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE1Q8N0S2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms