Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PLD3Q8IV08 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PLD3Q8IV08 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PLD3Q8IV08 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms