Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IFNL1Q8IU54 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFNL1Q8IU54 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IFNL1Q8IU54 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFNL1Q8IU54 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms