Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB11FIP4Q86YS3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RAB11FIP4Q86YS3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAB11FIP4Q86YS3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAB11FIP4Q86YS3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms