Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SFR1Q86XK3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SFR1Q86XK3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SFR1Q86XK3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms