Protein–RNA interactions for Protein: Q86VU5

COMTD1, Catechol O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTD1Q86VU5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COMTD1Q86VU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms