Protein–RNA interactions for Protein: Q86UB9

TMEM135, Transmembrane protein 135, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM135Q86UB9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM135Q86UB9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM135Q86UB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM135Q86UB9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM135Q86UB9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms