Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG4DQ86TL0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG4DQ86TL0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms