Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMC3Q7Z5M5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMC3Q7Z5M5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms