Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTF1AQ7RTS3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTF1AQ7RTS3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
PTF1AQ7RTS3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTF1AQ7RTS3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms