Protein–RNA interactions for Protein: Q7L804

RAB11FIP2, Rab11 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP2Q7L804 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP2Q7L804 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP2Q7L804 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP2Q7L804 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms