Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
RUFY3Q7L099 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RUFY3Q7L099 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RUFY3Q7L099 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RUFY3Q7L099 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms