Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BNC2Q6ZN30 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BNC2Q6ZN30 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BNC2Q6ZN30 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms