Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPOCD1Q6ZMY3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPOCD1Q6ZMY3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPOCD1Q6ZMY3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPOCD1Q6ZMY3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms