Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDZRN4Q6ZMN7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDZRN4Q6ZMN7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZRN4Q6ZMN7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms