Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYHR1Q6ZMK1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CYHR1Q6ZMK1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYHR1Q6ZMK1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYHR1Q6ZMK1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms