Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00575Q6W349 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms