Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXK5

LRRN1, Leucine-rich repeat neuronal protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1Q6UXK5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRN1Q6UXK5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRN1Q6UXK5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LRRN1Q6UXK5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRN1Q6UXK5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LRRN1Q6UXK5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRN1Q6UXK5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LRRN1Q6UXK5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms