Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BLOC1S2Q6QNY1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BLOC1S2Q6QNY1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms